環境體學工作坊小叮嚀
所有與會者:
- 請自備水杯(會場僅提供少量馬克杯自行清洗使用)。
- 本工作坊亦接受現場報名。
- 會議中午可於一樓之C101教室(學生為主)吃便當;老師們煩請至二樓之B208會議室用餐。
口頭報告講員、致詞來賓:
- 因報告時間簡短,為保持會議進行順暢,請準備投影片檔案存至會場提供之筆電,恕不接受使用個人筆電。
- 投影片說明文字建議32 pt以上,至少24 pt,以方便另一教室演講轉播之觀看。
- 投影片必須為Microsoft Powerpoint或PDF格式,內容如有影片、聲音、演講時需要上網,或投影片有特殊格式,請於會議前盡早告知。
- 各場次報告時間:環境樣品採集與製備(I)、(II):8分鐘;次世代基因體定序平台:25分鐘;資料分析:18分鐘;新興體學技術:25分鐘。除「次世代基因體定序平台」與「新興體學技術」場次有5分鐘提問外,其餘場次之問題請於分組討論時發問。
- 有住宿、申請交通費需求請提前告知。欲補助交通費(30公里以上)請準備火車/高鐵票票根。
分組討論主持人:
- 為使分組討論順利進行,請預先準備至少3個題目以供討論。
- 分組討論會場會準備筆電供投影使用。
2018 環境微生物體學方法工作坊 錄取名單
與會的朋友請注意,
為提倡環保、減少資源浪費,請自行攜帶餐具及飲水器具,
若使用會場提供之器具,敬請重覆使用,用畢後自行清理乾淨。
Bashir Hussain | Hsiu-An Chu | 丁偉峻 | 于昌平 | 王炳南 | 王郁甯 |
王博緯 | 古喬羽 | 白暄 | 朱虹綾 | 朱順傑 | 何新榮 |
何翰蓁 | 何攖寧 | 吳正杰 | 吳宇 | 吳克峰 | 吳佩勳 |
吳佩樺 | 吳怡儒 | 吳思霈 | 吳柏青 | 吳衎 | 吳晉嘉 |
宋沛霖 | 李成正 | 李芊穎 | 李旻翰 | 李羿澄 | 李庭儀 |
李國萍 | 李學霖 | 卓坤慶 | 卓舒婷 | 周育慈 | 周林 |
林大晖 | 林元春 | 林可莉 | 林如樺 | 林依蓉 | 林宛柔 |
林芝 | 林芸琪 | 林青平 | 林耕民 | 林湘凌 | 林詠瑞 |
林詩涵 | 邱宜芳 | 邱璵芩 | 邵勇先 | 柯惠棉 | 柯嘉昀 |
柯叡澤 | 柳韋安 | 洪邦喻 | 洪念慈 | 洪昆瑨 | 洪俊婎 |
胡安誼 | 唐嘉鴻 | 徐中琪 | 高麗珠 | 張芮馨 | 張晁瑞 |
張珮君 | 張朝欽 | 張鈞暘 | 梁志銘 | 許雅婷 | 許瑋真 |
許嘉合 | 郭志鴻 | 郭彧廷 | 陳育囷 | 陳宜龍 | 陳昌傑 |
陳治楨 | 陳俊堯 | 陳俞瑾 | 陳炯文 | 陳盈貝 | 陳韋廷 |
陳聖中 | 陳翰德 | 陳薇羽 | 陳薏瑤 | 傅瀚儀 | 曾于芳 |
曾廣瑜 | 黃子晏 | 黃郁媞 | 黃翊翔 | 黃雪莉 | 黃逸喬 |
楊又齊 | 楊玉良 | 楊姍樺 | 楊宜芳 | 楊茱芳 | 楊程安 |
葉元鳴 | 葉治甫 | 葉馨翊 | 董柏成 | 詹凱帆 | 詹雅帆 |
劉冠麟 | 劉筱君 | 劉鎮 | 蔡乙鳴 | 蔡怡陞 | 鄧文玲 |
鄧昕孟 | 鄭安琪 | 鄭涵丹 | 鄭傑仁 | 鄭琬萱 | 盧秀真 |
蕭淞云 | 蕭彰志 | 錢亞筠 | 韓喬融 | 簡嘉緯 | 嚴仲陽 |
蘇敬倫 | 蘇煜程 | 龔泓睿 |
2018 環境微生物體學方法工作坊
日期:2018/09/06~07
時間:09:00~17:30
地點:中研院跨領域大樓1F
會議議程
2018/09/06 (星期四)
09:00-09:30 報到
09:30-09:35 開場致詞 湯森林研究員
09:35-09:45 來賓致詞 于宏燦教授/台灣大學生命科學系
09:45-10:00 團體照
10:00-12:30 環境樣品採集與製備 (I) (主持人:江殷儒副研究員/童心欣教授)
10:00-11:10 口頭報告
水環境微生物群 (主持人:江殷儒副研究員)
-講員: 童心欣教授/台灣大學環境工程學研究所
講題: 自來水菌體濃縮及核酸萃取
-講員: 吳哲宏教授/成功大學環境工程學系
講題: 土壤地下水微生物的採樣及核酸萃取
-講員: 胡安誼博士後研究員/台灣大學環境工程學研究所
講題: 汙水處理廠之活性汙泥之核酸萃取
-講員: 呂曉沛博士後研究員/台灣大學海洋學研究所
講題: 海洋浮游生物採樣及核酸萃取
陸域環境微生物群 (主持人:童心欣教授)
-講員: 林育德博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: 森林土壤細菌族群 DNA 之萃取
-講員: 塗子萱博士後研究員/台灣大學地質系
講題: 底泥樣本的細胞分離與DNA萃取
-講員: 魏廷翔博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: 冷熱沙漠石頭中的微生物DNA萃取
11:10-11:20 茶敘
11:20-12:30 分組討論 (I)
組別1 (大演講廳): 淡水與人工環境 (主持人: 童心欣教授)
組別2 (C101教室): 海洋環境 (主持人: 湯森林研究員)
組別3 (C102教室): 陸域環境 (主持人: 林立虹教授)
12:30-13:30 午餐
13:30-14:30 次世代基因體定序平台 (主持人:吳育瑋助理教授)
-講員: 周素珍研究副技師/基因體學技術核心實驗室(中央研究院植物暨微生物學研究所)
講題: Sample requirements and NGS library preparation
-講員: 呂美曄研究副技師/新世代基因體定序核心實驗室(中央研究院生物多樣性研究中心)
講題: Selecting NGS platforms for your microbiome experiments
14:30-15:00 茶敘
15:00-17:30 環境樣品採集與製備 (II) (主持人:吳哲宏副教授)
15:00-16:10 口頭報告
真核微生物與共生微生物群
-講員: 湯森林研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: 增幅16S rRNA基因之注意事項
-講員: 劉少倫副教授/東海大學生命科學系
講題: 如何快速有效分析環境樣本中的單細胞藻和大型藻多樣性:樣本採集保存及分子分析流程之經驗分享
-講員: 吳羽婷助理教授/屏東科技大學森林系
講題: 卡氏櫧(Castanopsis carlesii))立木心材腐朽真菌群落結構的偵測
-講員: 翁杰愔研究助理/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: 發酵槽豬糞之微生物DNA萃取
-講員: 呂曉沛博士後研究員/ 台灣大學海洋學研究所
講題: 野生囓齒動物消化道微生物之樣本採集與保存經驗談
-講員: 吳偉愷醫師/台灣大學醫學院附設醫院
講題: 人類糞便微菌叢16S rRNA基因檢測流程之優化
-講員: 陳政宇研究助理/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: 淡水沼蝦沙腸微生物之DNA萃取
16:10-16:20 茶敘
16:20-17:30 分組討論 (II)
組別1 (大演講廳): 真核生物之分子標誌 (主持人: 劉少倫副教授)
組別2 (C101教室):人類腸道菌相 (主持人: 吳偉愷醫師)
組別3 (C102教室): 動物腸道及其他環境樣本菌相 (主持人: 呂曉沛博士)
2018/09/07 (星期五)
09:00-09:30 報到
09:30-11:00 資料分析 (主持人:郭志鴻副研究員)
-講員: 謝志豪教授/台灣大學海洋學研究所
講題: 微生物群聚分析常見的統計問題
-講員: 廖玉潔副研究員/ 國衛院群體健康科學研究所
講題: 總體基因體學的分析程序
-講員: 邵遵文博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: MetaMIS的原理與應用
-講員: 吳育瑋助理教授/臺北醫學大學醫學資訊研究所
講題: 透過分群技術分析多體學 (multi-omics)
11:00-11:30 茶敘
11:30-12:30 新興體學技術 (主持人:湯森林研究員)
-講員: 劉勃佑博士/台灣大學生態學與演化生物學研究所
講題: 非標的性代謝體學在微生物生態學上的多體學整合研究策略
-講員: 施朝仁研究員/生物資源保存及研究中心
講題: 微生物培養體學的發展與應用
-講員: 湯森林研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
講題: 單一細菌基因體經驗談
12:30-13:30 午餐
13:30-14:30 綜合討論
14:30-15:00 閉幕
15:30-17:00 檢討會議(非公開議程)