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一個關於微生物的心情故事!

環境體學工作坊小叮嚀

所有與會者

  • 請自備水杯(會場僅提供少量馬克杯自行清洗使用)。
  • 本工作坊亦接受現場報名。
  • 會議中午可於一樓之C101教室(學生為主)吃便當;老師們煩請至二樓之B208會議室用餐。

 

口頭報告講員致詞來賓

  • 因報告時間簡短,為保持會議進行順暢,請準備投影片檔案存至會場提供之筆電,恕不接受使用個人筆電。
  • 投影片說明文字建議32 pt以上,至少24 pt,以方便另一教室演講轉播之觀看。
  • 投影片必須為Microsoft Powerpoint或PDF格式,內容如有影片、聲音、演講時需要上網,或投影片有特殊格式,請於會議前盡早告知。
  • 各場次報告時間:環境樣品採集與製備(I)、(II):8分鐘;次世代基因體定序平台:25分鐘;資料分析:18分鐘;新興體學技術:25分鐘。除「次世代基因體定序平台」與「新興體學技術」場次有5分鐘提問外,其餘場次之問題請於分組討論時發問。
  • 有住宿、申請交通費需求請提前告知。欲補助交通費(30公里以上)請準備火車/高鐵票票根。

 

分組討論主持人

  • 為使分組討論順利進行,請預先準備至少3個題目以供討論。
  • 分組討論會場會準備筆電供投影使用。

2018 環境微生物體學方法工作坊 錄取名單

與會的朋友請注意,

為提倡環保、減少資源浪費,請自行攜帶餐具及飲水器具

若使用會場提供之器具,敬請重覆使用,用畢後自行清理乾淨

Bashir Hussain Hsiu-An Chu 丁偉峻 于昌平 王炳南 王郁甯
王博緯 古喬羽 白暄 朱虹綾 朱順傑 何新榮
何翰蓁 何攖寧 吳正杰 吳宇 吳克峰 吳佩勳
吳佩樺 吳怡儒 吳思霈 吳柏青 吳衎 吳晉嘉
宋沛霖 李成正 李芊穎 李旻翰 李羿澄 李庭儀
李國萍 李學霖 卓坤慶 卓舒婷 周育慈 周林
林大晖 林元春 林可莉 林如樺 林依蓉 林宛柔
林芝 林芸琪 林青平 林耕民 林湘凌 林詠瑞
林詩涵 邱宜芳 邱璵芩 邵勇先 柯惠棉 柯嘉昀
柯叡澤 柳韋安 洪邦喻 洪念慈  洪昆瑨 洪俊婎
胡安誼 唐嘉鴻 徐中琪 高麗珠 張芮馨 張晁瑞
張珮君 張朝欽 張鈞暘 梁志銘 許雅婷 許瑋真
許嘉合 郭志鴻 郭彧廷 陳育囷 陳宜龍 陳昌傑
陳治楨 陳俊堯 陳俞瑾 陳炯文 陳盈貝 陳韋廷
陳聖中 陳翰德 陳薇羽 陳薏瑤 傅瀚儀 曾于芳
曾廣瑜 黃子晏 黃郁媞 黃翊翔 黃雪莉 黃逸喬
楊又齊 楊玉良 楊姍樺 楊宜芳 楊茱芳 楊程安
葉元鳴 葉治甫 葉馨翊 董柏成 詹凱帆 詹雅帆
劉冠麟 劉筱君 劉鎮 蔡乙鳴 蔡怡陞 鄧文玲
鄧昕孟 鄭安琪 鄭涵丹 鄭傑仁 鄭琬萱 盧秀真
蕭淞云 蕭彰志 錢亞筠 韓喬融 簡嘉緯 嚴仲陽
蘇敬倫 蘇煜程 龔泓睿      

 

2018 環境微生物體學方法工作坊

日期:2018/09/06~07
時間:09:00~17:30
地點:中研院跨領域大樓1F

會議議程

2018/09/06 (星期四)
09:00-09:30 報到

09:30-09:35 開場致詞 湯森林研究員

09:35-09:45 來賓致詞 于宏燦教授/台灣大學生命科學系

09:45-10:00 團體照

10:00-12:30 環境樣品採集與製備 (I) (主持人:江殷儒副研究員/童心欣教授)

10:00-11:10 口頭報告

水環境微生物群 (主持人:江殷儒副研究員)
-講員: 童心欣教授/台灣大學環境工程學研究所
    講題: 自來水菌體濃縮及核酸萃取
-講員: 吳哲宏教授/成功大學環境工程學系
    講題: 土壤地下水微生物的採樣及核酸萃取
-講員: 胡安誼博士後研究員/台灣大學環境工程學研究所
    講題: 汙水處理廠之活性汙泥之核酸萃取
-講員: 呂曉沛博士後研究員/台灣大學海洋學研究所
    講題: 海洋浮游生物採樣及核酸萃取
陸域環境微生物群 (主持人:童心欣教授)
-講員: 林育德博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 森林土壤細菌族群 DNA 之萃取
-講員: 塗子萱博士後研究員/台灣大學地質系
    講題: 底泥樣本的細胞分離與DNA萃取
-講員: 魏廷翔博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 冷熱沙漠石頭中的微生物DNA萃取

11:10-11:20 茶敘

11:20-12:30 分組討論 (I)

組別1 (大演講廳): 淡水與人工環境 (主持人: 童心欣教授)
組別2 (C101教室): 海洋環境 (主持人: 湯森林研究員)
組別3 (C102教室): 陸域環境 (主持人: 林立虹教授)

12:30-13:30 午餐

13:30-14:30 次世代基因體定序平台 (主持人:吳育瑋助理教授)

-講員: 周素珍研究副技師/基因體學技術核心實驗室(中央研究院植物暨微生物學研究所)
    講題: Sample requirements and NGS library preparation
-講員: 呂美曄研究副技師/新世代基因體定序核心實驗室(中央研究院生物多樣性研究中心)
    講題: Selecting NGS platforms for your microbiome experiments

14:30-15:00 茶敘

15:00-17:30 環境樣品採集與製備 (II) (主持人:吳哲宏副教授)

15:00-16:10 口頭報告

真核微生物與共生微生物群
-講員: 湯森林研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 增幅16S rRNA基因之注意事項
-講員: 劉少倫副教授/東海大學生命科學系
    講題: 如何快速有效分析環境樣本中的單細胞藻和大型藻多樣性:樣本採集保存及分子分析流程之經驗分享
-講員: 吳羽婷助理教授/屏東科技大學森林系
    講題: 卡氏櫧(Castanopsis carlesii))立木心材腐朽真菌群落結構的偵測
-講員: 翁杰愔研究助理/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 發酵槽豬糞之微生物DNA萃取
-講員: 呂曉沛博士後研究員/ 台灣大學海洋學研究所
    講題: 野生囓齒動物消化道微生物之樣本採集與保存經驗談
-講員: 吳偉愷醫師/台灣大學醫學院附設醫院
    講題: 人類糞便微菌叢16S rRNA基因檢測流程之優化
-講員: 陳政宇研究助理/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 淡水沼蝦沙腸微生物之DNA萃取

16:10-16:20 茶敘

16:20-17:30 分組討論 (II)

組別1 (大演講廳): 真核生物之分子標誌 (主持人: 劉少倫副教授)
組別2 (C101教室):人類腸道菌相 (主持人: 吳偉愷醫師)
組別3 (C102教室): 動物腸道及其他環境樣本菌相 (主持人: 呂曉沛博士)

2018/09/07 (星期五)

09:00-09:30 報到

09:30-11:00 資料分析 (主持人:郭志鴻副研究員)

-講員: 謝志豪教授/台灣大學海洋學研究所
    講題: 微生物群聚分析常見的統計問題
-講員: 廖玉潔副研究員/ 國衛院群體健康科學研究所
    講題: 總體基因體學的分析程序
-講員: 邵遵文博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: MetaMIS的原理與應用
-講員: 吳育瑋助理教授/臺北醫學大學醫學資訊研究所
    講題: 透過分群技術分析多體學 (multi-omics)

11:00-11:30 茶敘

11:30-12:30 新興體學技術 (主持人:湯森林研究員)

-講員: 劉勃佑博士/台灣大學生態學與演化生物學研究所
    講題: 非標的性代謝體學在微生物生態學上的多體學整合研究策略
-講員: 施朝仁研究員/生物資源保存及研究中心
    講題: 微生物培養體學的發展與應用
-講員: 湯森林研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 單一細菌基因體經驗談

12:30-13:30 午餐

13:30-14:30 綜合討論

14:30-15:00 閉幕

15:30-17:00 檢討會議(非公開議程)

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