2018 環境微生物體學方法工作坊

日期:2018/09/06~07
時間:09:00~17:30
地點:中研院跨領域大樓1F

會議議程

2018/09/06 (星期四)
09:00-09:30 報到

09:30-09:35 開場致詞 湯森林研究員

09:35-09:45 來賓致詞 于宏燦教授/台灣大學生命科學系

09:45-10:00 團體照

10:00-12:30 環境樣品採集與製備 (I) (主持人:江殷儒副研究員/童心欣教授)

10:00-11:10 口頭報告

水環境微生物群 (主持人:江殷儒副研究員)
-講員: 童心欣教授/台灣大學環境工程學研究所
    講題: 自來水菌體濃縮及核酸萃取
-講員: 吳哲宏教授/成功大學環境工程學系
    講題: 土壤地下水微生物的採樣及核酸萃取
-講員: 胡安誼博士後研究員/台灣大學環境工程學研究所
    講題: 汙水處理廠之活性汙泥之核酸萃取
-講員: 呂曉沛博士後研究員/台灣大學海洋學研究所
    講題: 海洋浮游生物採樣及核酸萃取
陸域環境微生物群 (主持人:童心欣教授)
-講員: 林育德博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 森林土壤細菌族群 DNA 之萃取
-講員: 塗子萱博士後研究員/台灣大學地質系
    講題: 底泥樣本的細胞分離與DNA萃取
-講員: 魏廷翔博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 冷熱沙漠石頭中的微生物DNA萃取

11:10-11:20 茶敘

11:20-12:30 分組討論 (I)

組別1 (大演講廳): 淡水與人工環境 (主持人: 童心欣教授)
組別2 (C101教室): 海洋環境 (主持人: 湯森林研究員)
組別3 (C102教室): 陸域環境 (主持人: 林立虹教授)

12:30-13:30 午餐

13:30-14:30 次世代基因體定序平台 (主持人:吳育瑋助理教授)

-講員: 周素珍研究副技師/基因體學技術核心實驗室(中央研究院植物暨微生物學研究所)
    講題: Sample requirements and NGS library preparation
-講員: 呂美曄研究副技師/新世代基因體定序核心實驗室(中央研究院生物多樣性研究中心)
    講題: Selecting NGS platforms for your microbiome experiments

14:30-15:00 茶敘

15:00-17:30 環境樣品採集與製備 (II) (主持人:吳哲宏副教授)

15:00-16:10 口頭報告

真核微生物與共生微生物群
-講員: 湯森林研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 增幅16S rRNA基因之注意事項
-講員: 劉少倫副教授/東海大學生命科學系
    講題: 如何快速有效分析環境樣本中的單細胞藻和大型藻多樣性:樣本採集保存及分子分析流程之經驗分享
-講員: 吳羽婷助理教授/屏東科技大學森林系
    講題: 卡氏櫧(Castanopsis carlesii))立木心材腐朽真菌群落結構的偵測
-講員: 翁杰愔研究助理/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 發酵槽豬糞之微生物DNA萃取
-講員: 呂曉沛博士後研究員/ 台灣大學海洋學研究所
    講題: 野生囓齒動物消化道微生物之樣本採集與保存經驗談
-講員: 吳偉愷醫師/台灣大學醫學院附設醫院
    講題: 人類糞便微菌叢16S rRNA基因檢測流程之優化
-講員: 陳政宇研究助理/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 淡水沼蝦沙腸微生物之DNA萃取

16:10-16:20 茶敘

16:20-17:30 分組討論 (II)

組別1 (大演講廳): 真核生物之分子標誌 (主持人: 劉少倫副教授)
組別2 (C101教室):人類腸道菌相 (主持人: 吳偉愷醫師)
組別3 (C102教室): 動物腸道及其他環境樣本菌相 (主持人: 呂曉沛博士)

2018/09/07 (星期五)

09:00-09:30 報到

09:30-11:00 資料分析 (主持人:郭志鴻副研究員)

-講員: 謝志豪教授/台灣大學海洋學研究所
    講題: 微生物群聚分析常見的統計問題
-講員: 廖玉潔副研究員/ 國衛院群體健康科學研究所
    講題: 總體基因體學的分析程序
-講員: 邵遵文博士後研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: MetaMIS的原理與應用
-講員: 吳育瑋助理教授/臺北醫學大學醫學資訊研究所
    講題: 透過分群技術分析多體學 (multi-omics)

11:00-11:30 茶敘

11:30-12:30 新興體學技術 (主持人:湯森林研究員)

-講員: 劉勃佑博士/台灣大學生態學與演化生物學研究所
    講題: 非標的性代謝體學在微生物生態學上的多體學整合研究策略
-講員: 施朝仁研究員/生物資源保存及研究中心
    講題: 微生物培養體學的發展與應用
-講員: 湯森林研究員/中央研究院生物多樣性研究中心
    講題: 單一細菌基因體經驗談

12:30-13:30 午餐

13:30-14:30 綜合討論

14:30-15:00 閉幕

15:30-17:00 檢討會議(非公開議程)

海報內容

發佈留言